Résultats du virus de l’appareil respiratoire inférieur chez les patients ventilés mécaniquement et atteints d’une pneumonie extra-hospitalière grave

Contexte Le rôle des infections virales dans l’étiologie des pneumonies communautaires sévères SCAP a été évalué prospectivement dans une unité de soins intensifs de niveau universitaire Méthodes Les données cliniques et les tests microbiologiques ont été évalués: hémocultures, antigènes pneumococciques et légionelles, Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia anticorps pneumoniae provenant de sérums appariés, et détection de virus respiratoire par réaction en chaîne par polymérase multiplex en temps réel PCR à partir d’écouvillonnages nasopharyngés et de prélèvements trachéaux inférieurs par tube d’intubation Résultats de patients SCAP ventilés mécaniquement hommes et femmes; âge médian, années, l’étiologie a été identifiée dans les cas% Il y avait des infections bactériennes pures%, probablement des infections virales pures%, et des infections bactériennes virales mixtes%, résultant en l’étiologie virale chez les patients% De virus,% ont été détectés des bronches % des écouvillonnages nasopharyngés Les cas de rhinovirus,% et les cas d’adénovirus,% étaient les résultats viraux les plus courants Le groupe d’étiologie bactérienne-virale avait les plus hauts niveaux de protéine C-réactive médiane, [ième percentiles, -], P =, avec l’étiologie probablement virale avait les plus bas niveaux de procalcitonine de pointe [th-ème percentiles, -] Les caractéristiques cliniques des étiologies bactériennes-virales bactériennes et mélangées pures étaient comparables Le séjour hospitalier était le plus long parmi le groupe bactérien contre les jours; P = Conclusions Les résultats viraux ont été démontrés chez près de la moitié des patients SCAP Les caractéristiques cliniques étaient similaires entre les groupes d’infections bactériennes virales bactériennes et mixtes. La fréquence de détection virale dépend de la disponibilité des techniques PCR et des échantillons respiratoires inférieurs.

Pneumonie extra-hospitalière, étiologie, infection virale, soins intensifsVoir le commentaire éditorial de Ruuskanen et Järvinen en pages -Pneumonie acquise en communauté La PAC est une maladie complexe Vingt pour cent à% des patients avec CAP sont hospitalisés Un dixième des patients hospitalisés avec une PAC sévère SCAP nécessite un traitement dans les unités de soins intensifs, nécessitant généralement un soutien ventilatoire ou un traitement de choc septique Les étiologies bactériennes de CAP et SCAP sont bien définies La bactérie la plus commune affectant tous les groupes de patients est Streptococcus pneumoniae; Mycoplasma pneumoniae et Chlamydia pneumoniae sont principalement présents chez les jeunes patients atteints de PAC. Legionella pneumophila est une cause importante de PAC dans le monde Environ un million de cas de CAP virale surviennent chaque année, dont la moitié chez les adultes. Les tests PCR qui ont été introduits au cours des dernières années, ont augmenté la capacité à détecter les virus respiratoires Selon les études publiées, les virus représentent% -% des cas de PAC chez les adultes À la connaissance des auteurs, seules les études publiées se sont concentrées sur l’étiologie virale du SCAP Le but de cette étude prospective était d’évaluer la présence et l’évolution clinique d’infections virales chez des patients SCAP ventilés mécaniquement, en utilisant une méthodologie de PCR multiplex.

MATÉRIAUX ET MÉTHODES

La population étudiée comprenait une cohorte de patients SCAP admis dans notre unité mixte de soins intensifs dans un hôpital universitaire de référence entre juin et mai. Pour les besoins de cette étude, une PAC sévère était définie comme une infection aiguë des voies respiratoires inférieures avec fièvre ou hypothermie, toux, ou dyspnée acquise en dehors de l’hôpital La présence d’une pneumonie a été confirmée par radiographie pulmonaire démontrant un nouvel infiltrat pulmonaire. Tous les patients remplissaient les critères de septicémie sévère Adultes âgés de & gt; années avec SCAP qui devaient nécessiter un traitement de soins intensifs pour & gt; heures et qui ont été mis sous ventilation mécanique pendant les premières heures suivant l’admission à l’USI ont été inclus dans cette étude Patients avec une espérance de vie & lt; heures en raison de la gravité de leur maladie ou dont le séjour à l’hôpital était & gt; Le comité d’éthique de l’hôpital a approuvé le protocole de l’étude et le consentement éclairé écrit a été demandé à chaque patient ou à ses proches. Les données suivantes ont été obtenues: âge, sexe, indice de masse corporelle, comorbidités préexistantes, maladie pulmonaire chronique, coronaropathie. score APACHE II , Nouveau Score de Physiologie Aiguë Simplifiée SAPS II , et Évaluation Quotidienne de l’Echec d’Organe Séquentiel Score SOFA Laboratoire de Physiologie Aiguë et d’Evaluation de la Santé Chronique Des données ont également été obtenues au niveau de la protéine C réactive quotidienne, de la procalcitonine [PCT], de la numération plaquettaire, du taux de lactate, du taux de créatinine et d’autres paramètres biochimiques, tout comme les données radiologiques. et les résultats cliniques, y compris un traitement antibiotique avant l’admission à l’hôpital et à l’unité de soins intensifs et des hémocultures avant et pendant le séjour en unité de soins intensifs. Les complications pulmonaires, telles que le liquide pleural, l’empyème et l’œdème alvéolaire, ont été enregistrées. La somme de l’indice de sévérité de la pneumonie PSI , CURB- confusion, l’urée, la fréquence respiratoire, score de pression artérielle , et les principaux critères IDAS / ATS nécessaires pour la ventilation mécanique invasive ou un choc septique nécessitant vasopressor [noradrénaline] perfusion et des critères mineurs pour SCAP ont également été calculés La longueur de l’unité de soins intensifs et les séjours à l’hôpital, les soins intensifs, les hospitalisations et les mortalités quotidiennes ont été analysés

Définitions

La définition de lésion rénale aiguë était basée sur le score SOFA rénal comme le taux de créatinine sérique SOFA = – μmol / L ou la diurèse quotidienne de & lt; mL / jour ou niveau de créatinine sérique SOFA & gt; μmol / L ou diurèse quotidienne de & lt; mL / jour pendant le séjour en USI Le choc septique a été défini selon les critères standards

Évaluation microbiologique

Bactéries

Pendant les premières heures après l’admission aux soins intensifs, des prélèvements sanguins ont été effectués sur chaque patient pour une hémoculture avec le système de surveillance automatique de la culture de sang BacT / Alert, des aspirateurs trachéobronchiques pour le diagnostic bactérien respiratoire et un échantillon d’urine pour l’antigène BinaxNOW S pneumoniae. détection de l’antigène pneumophila BinaxNOW, Alere Scarborough Le liquide pleural a été cultivé si des ponctions pleurales ou des drainages étaient nécessaires Des échantillons sériques appariés pour la détection sérologique de M pneumoniae et C pneumoniae ont également été obtenus à l’admission aux soins intensifs et avant la sortie de l’hôpital. rapport & gt; Les échantillons de BAL ont été colorés et cultivés quantitativement pour des pathogènes bactériens et des champignons. De plus, les échantillons de BAL ont été soumis à une coloration Papanicolau et May-Grunwald-Giemsa pour obtenir des numérations différentielles La coloration à l’argent méthylamine de Gomori pour Pneumocystis jirovecii a été détectée par coloration, culture, ou PCRA microorganisme était considéré comme une cause certaine de SCAP s’il était cultivé à partir de sang Une bactérie était considérée comme l’étiologie de SCAP seulement si elle était de bonne qualité seuil d’aspiration bronchique ≥ unités formant des colonies [UFC] ou seuil de BAL ≥ UFC, ou si l’antigène urinaire pour S pneumoniae ou L pneumoniae était positif La présence d’anticorps anti-immunoglobuline M et / ou une augmentation significative au moins multiplication des immunoglobulines G les niveaux d’anticorps entre les échantillons de sérum appariés ont été considérés comme signifiant un pneumoniae M aiguë ou C Infection à pneumoniae L’intervalle médian entre les échantillons de sérum appariés était de plusieurs jours

Virus

Trois séries de prélèvements NP nasopharyngés ont été collectés pour la détection des virus respiratoires. Les écouvillons NP ont été obtenus à l’aide d’un pinceau Copan et chaque écouvillon a été stocké dans un tube stérile et congelé à – ° C jusqu’à l’analyse. Les échantillons BAL ont été envoyés aux laboratoires de microbiologie et de pathologie de cet hôpital pour d’autres diagnostics, conformément à la pratique normale. Deux échantillons de liquide BAL ont été également stockés à – ° C pour une analyse PCR à un Si une étude BAL n’était pas possible, une bronchoscopie normale a été réalisée ou un échantillon d’aspiration bronchique a été prélevé par le tube d’intubation pour la détection du virus. Les prélèvements de NP et les prélèvements de liquide ou d’aspiration bronchique ont été envoyés pour analyse de virus respiratoires. Virus Diagnostics Laboratory, Université de Turku Tous les écouvillonnages nasopharyngiens, les prélèvements bronchiques et les échantillons de BAL ont été analysés par PCR. Kit de test CR Anyplex RV, Seegene, Corée du Sud a été utilisé pour détecter les virus adénovirus, influenza A et B, virus parainfluenza, rhinovirus, virus respiratoire syncytial A et B, bocavirus, coronavirus E, NL et OC, métapneumovirus et entérovirus En outre, un test de PCR interne a été utilisé pour détecter les entérovirus et les rhinovirus, comme décrit précédemment Les virus ont été considérés comme une cause probable de SCAP lorsqu’ils ont été détectés dans des tampons NP par PCR Un diagnostic définitif d’une cause virale de SCAP nécessité d’un résultat PCR positif dans les échantillons des voies respiratoires inférieures

Classification des patients SCAP

Types étiologiques de SCAP ont été classés comme suit: infection bactérienne pure, si les examens étiologiques ont révélé que des bactéries; infection virale probablement pure, si seulement les découvertes virales ont été récupérées; et infection bactérienne-virale mixte, si les examens étiologiques ont donné des résultats à la fois bactériens et viraux. Il y avait aussi un groupe «sans étiologie», constitué de patients chez lesquels les examens bactérien et viral sont restés négatifs

Analyses statistiques

Pour les variables continues, on a utilisé les médianes avec les percentiles th et les pourcentages ont été utilisés pour les variables catégorielles. Le groupe viral probablement pur a été exclu des comparaisons statistiques en raison du petit nombre de cas Comparaisons de variables continues entre bactérien pur et mixte bactérien-viral les groupes ont été analysés en utilisant le test t de Student ou le test U de Mann-Whitney; les variables catégorielles ont été analysées en utilisant les tests exacts de Fisher ou Two Les valeurs P bilatérales ont été calculées Toutes les analyses ont été effectuées en utilisant SPSS pour la version Windows IBM SPSS, Armonk, New York

RÉSULTATS

Un total de patients SCAP sous ventilation mécanique étaient applicables à l’étude. Parmi ceux-ci, les patients ont été exclus pour les raisons suivantes: espérance de vie & lt; Après l’exclusion, le groupe d’étude final était composé de patients SCAP. Les échantillons suivants ont été prélevés et des tests ont été effectués après examen pour tous les patients SCAP: des échantillons de sérum pour la détection des anticorps M pneumoniae et C pneumoniae étaient disponibles chez tous les patients, y compris un échantillon de LBA bronchoscopique à fibres optiques chez les patients%; L’étiologie de SCAP a été définie en% des cas viagra feminin. Une étiologie bactérienne pure a été diagnostiquée pour% des patients. Les découvertes microbiologiques parmi les groupes bactériens et bactériens purs sont montrées dans le tableau Streptococcus pneumoniae. Le pneumocoque était le seul agent pathogène dans les cas de patients, S pneumoniae était cultivé dans% des patients dans le sang et% des patients dans l’aspiration bronchique, et l’antigène pneumococcique était présent dans% des cas d’infections bactériennes ou virales pures. positif dans l’urine des cas% Une infection aiguë à M pneumoniae a été observée dans les cas%, et était le seul microbe étiologique dans les cas, alors qu’il était présent comme un copathogène dans les patients restants Tableau Toutes les bactéries identifiées étaient sensibles aux antibiotiques utilisés pour le traitement de la pneumonie Aucun cas de pneumonie C, L pneumophila, P jirovecii, ou Mycobacterium Deux patients dans le groupe bactérien pur et un patient dans le groupe viral pur probable ont développé un empyème plus tard au cours de leur séjour à l’hôpital

s – NA F – – – – Rhinovirus – NA M S pneumoniae – – Adénovirus – NA F S pneumoniae – Rhinovirus – NA F S pneumoniae – Virus respiratoire syncytial M S pneumoniae a Entérovirus NA F S pneumoniae – – – Rhinovirus F S pneumoniae – – Rhinovirus F S pneumoniae – – – Rhinovirus – F S pneumoniae – – – AdénovirusEnterovirus – – F S pneumoniae b Rhinovirus – – M S aureus – – – Rhinovirus – NA M H influenzae – – Rhinovirus – M S pneumoniae – – Rhinovirus – – F – – – – RhinovirusAdenovirus – – Aucun groupe étiologique n = F – – – – – – – – NA M – – – – – – – – – F – – – – – – – NA F – – – – – – – – – Sexe Age Bactéries Trachée Culture sanguine U-Stpnag Virus Mycoplasma NP Trachée BAL Groupe bactérien pur n = M S pneumoniae – – – – – – M S pneumoniae – – – – – – – F S pneumoniae – – – – – NA M S pneumoniae – – – – – F S pneumoniae – – – – – – F E coli – – – – – – F S pneumoniae – – – – – – NA M S pneumoniae – – – – – – – F S pneumoniae – – – – – – F – – – – a – – – – F pneumoniae – – – – – – M S pneumoniae – – – – – NA M S aureus – – – – – – – M S pneumoniae – – – – – – F – – – – – – – NA F S pneumoniae – – – – – – F S pneumoniae – – – – – – M S pneumoniae – – – – NA F K pneumoniae – – b – – – – F S pneumoniae – – – – NA M – – – – a – – – – Groupe viral probablement pur n = F – – – – – Coronavirus – NA F – – – – – Virus Influenza A – NA F – – – – – Rhinovirus – – M – – – – – Adénovirus – – M – – – – – Rhinovirus – – Groupe viral bactérien n = M S pneumoniae – – Rhinovirus – M S pneumoniae – – Virus parainfluenza – NA M P aeruginosa – – Rhinovirus – NA F H influenzaeM catarrhalis – – – Rhinovirus – – F S pneumoniae – Coronavirus – NA F – – – – Rhinovirus – NA M S pneumoniae – – Adénovirus – NA F S pneumoniae – Rhinovirus – NA F S pneumoniae – Virus respiratoire syncytial M S pneumoniae a Entérovirus NA F S pneumoniae – – – Rhinovirus F S pneumoniae – – Rhinovirus F S pneumoniae – – – Rhinovirus – F S pneumoniae – – – AdénovirusEnterovirus – – F S pneumoniae b Rhinovirus – – M S aureus – – – Rhinovirus – NA M H influenzae – – Rhinovirus – M S pneumoniae – – Rhinovirus – – F – – – – un RhinovirusAdenovirus – – Aucun groupe étiologique n = F – – – – – – – – NA M – – – – – – – – – F – – – – – – – – NA F – – – – – – – – – Abréviations:, constatation positive; -, résultat négatif; BAL, lavage broncho-alvéolaire; E coli, Escherichia coli; H influenzae, Haemophilus influenzae; K pneumoniae, Klebsiella pneumoniae; M catarrhalis, Moraxella catarrhalis; NA, non disponible; NP, écouvillon nasopharyngé; P aeruginosa, Pseudomonas aeruginosa; S aureus, Staphylococcus aureus; S pneumoniae, Streptococcus pneumoniae; trachée, aspiration endotrachéale; U-Stpnag, antigène pneumococcique urinaire Au moins multiplication des anticorps IgG de l’immunoglobuline Gb Moins de multiplication des anticorps IgG et de l’immunoglobuline M changement d’anticorps de négatif à positifVue Large Une étiologie virale de SCAP a été diagnostiquée chez les patients% Virus identifiés comme seuls Tableau Vingt-six virus ont été détectés parmi les patients SCAP Tableau Des virus identifiés,% ont été détectés à partir d’échantillons bronchiques,% ont été détectés à partir de prélèvements de NP seulement, et à la fois NP et Tableau Le rhinovirus a été détecté dans les échantillons bronchiques et dans les écouvillonnages nasopharyngés. Le test de PCR commercial a manqué des patients avec des résultats de rhinovirus positifs identifiés par un test de PCR interne. trouvé en% cas Les autres résultats viraux étaient les suivants: cas de coronavirus, cas d’entérovirus Cinq patients ont présenté un tableau viral SCAP probablement pur. Dans le groupe bactérien viral mixte, la combinaison la plus fréquente était S pneumoniae et le rhinovirus, ce qui a été le cas chez les patients atteints de grippe A, de virus respiratoire syncytial et de parainfluenza. Les groupes présentant des infections bactériennes pures et des infections virales bactériennes étaient comparables A l’admission à l’hôpital, l’antibiothérapie avait déjà été initiée chez les patients%: dans le groupe bactérien%, dans le groupe bactérien-viral%, dans le groupe viral%, et des patients sans étiologie discernable Les hémocultures étaient positives pour% des patients sans antibiotiques antérieurs et% de patients avec antibiotiques P = Les patients dans l’infection bactérienne-virale mixte groupe semblait avoir besoin d’une perfusion plus longue de noradrénaline que le groupe d’infection bactérienne pure, mais les La référence n’était pas statistiquement significative P =

Tableau Caractéristiques de base des patients atteints de pneumonie communautaire grave Variable Groupe bactérien pur n = Groupe bactérien-viral n = Groupe viral probablement pur n = Non Groupe d’étiologie n = P Âge Valuea, y – – – – & gt; Sexe masculin IMC – – – – Comorbidité & gt; Fumer & gt; Alcoolisme Durée des symptômes avant le diagnostic de la pneumonie, d – – – – Antibiotiques avant l’admission à l’hôpital & gt; Antibiotiques avant les hémocultures Radiographie thoracique infiltration diffuse & gt; Choc septique à l’admission Atteinte rénale aiguë Durée de la ventilation mécanique, h – – – Temps de perfusion de noradrénaline, h – – – – Rapport PF à l’admission aux soins intensifs – – – – PF ratiob – – – – Groupe bactérien pur variable n = bactérien- Groupe viral n = Groupe viral probablement pur n = Aucun groupe d’étiologie n = P Âge de Valuea, y – – – – & gt; Sexe masculin IMC – – – – Comorbidité & gt; Fumer & gt; Alcoolisme Durée des symptômes avant le diagnostic de la pneumonie, d – – – – Antibiotiques avant l’admission à l’hôpital & gt; Antibiotiques avant les hémocultures Radiographie thoracique infiltration diffuse & gt; Choc septique à l’admission Accident rénal aigu Durée de la ventilation mécanique, h – – – Temps de perfusion de noradrénaline, h – – – – Rapport PF à l’admission en unité de soins intensifs – – – – PF ratiob – – – – Les valeurs sont présentées en% ou en médiane e-percentileAbbreviations: IMC, indice de masse corporelle; Unité de soins intensifs, unité de soins intensifs; PF, PaO / FiO mmHga Comparaison entre les groupes d’infections bactériennes et mixtes b Rapport PF le plus bas au cours de la première journée de soins intensifsVoir les comparaisons de résultats de laboratoire et de résultats pour les groupes bactériens purs, bactériens-viraux, probablement viraux purs et non étiologie “sont présentés dans le tableau Les résultats pour les groupes d’infection bactérienne-bactérienne pure et bactérienne-virale étaient comparables Le groupe bactérien-viral avait des niveaux plus élevés de CRP de pointe par rapport à ; P = Le groupe d’infection virale pure, avec patients, avait les valeurs PCT les plus basses

Tableau Comparaison des paramètres d’admission et des données de résultats chez les patients atteints de pneumonie communautaire grave Paramètre Groupe bactérien pur n = Groupe bactérien-viral n = Groupe viral probablement pur n = Non Groupe d’étiologie n = P Valuea CRP, admission, mg / L – – – – CRP, mg / L, pic – – – – PCT, admission, μg / L – – – – PCT, μg / L, pic – – – – nombre de globules blancs, × / L – – – – plaquettes, × / L – – – – Séjour à l’USI, d – – – – Séjour hospitalier, d – – – – Mortalité journalière à l’USI Mortalité hospitalière Paramètre Groupe bactérien pur n = Groupe bactérien-viral n = Groupe viral probablement pur n = Non Groupe d’étiologie n = P Valuea CRP, admission, mg / L – – – – CRP, mg / L, pic – – – – PCT, admission, μg / L – – – – PCT, μg / L, pic – – – – Nombre de globules blancs, × / L – – – – Plaquettes, × / L – – – – Séjour en unité de soins intensifs, d – – – – Séjour hospitalier, d – – – – mortalité ICU mortalité par jour Mortalité hospitalière Les valeurs sont présentées en% ou percentile médian du percentileAbbreviations: CRP, protéine C-réactive; Unité de soins intensifs, unité de soins intensifs; PCT, procalcitonine; WBC, globules blancs Comparaison entre une infection bactérienne seulement et un groupe d’infection virale bactérienneVoir LargeOn admission, chaque patient remplissait les critères principaux IDSA / ATS Tableau: patients nécessitant une ventilation mécanique; Les patients restants étaient en choc septique nécessitant des vasopresseurs, et leur état s’est détérioré plus tard, nécessitant une ventilation mécanique. Selon les valeurs médianes, les patients SCAP de tous les groupes d’étiologie appartenaient au groupe de gravité IV du PSI et les scores CURB médians variaient de à Table; Comme le montre également le tableau Table As Table, le groupe des bactéries pures avait les scores APACHE II les plus élevés à l’admission P = Le séjour médian aux USI ne différait pas entre les groupes, alors que le séjour hospitalier était le plus long parmi le groupe bactérien P = Table

Scores de gravité de la table des patients atteints de pneumonie acquise en communauté grave Paramètre Groupe bactérien pur n = Groupe bactérien-viral n = Groupe viral probablement pur n = Non Groupe d’étiologie n = P Valuea APACHE II – – – – SAPS II – – – – SOFA ha – – – – Critères principaux IDSA / ATS remplis Nécessité d’une ventilation mécaniqueb Choc septique avec besoin de vasopresseurs Indice de sévérité de pneumonie – – – – CURB- – – – – Paramètre Groupe bactérien pur n = Groupe bactérien-viral n = Groupe viral probablement pur n = Non Groupe étiologique n = P Valuea APACHE II – – – – SAPS II – – – – SOFA ha – – – – Critères principaux IDSA / ATS remplis Nécessité de ventilation mécaniqueb Choc septique avec besoin de vasopresseurs Indice de gravité de la pneumonie – – – – CURB- – – – – Les valeurs sont présentées en No% ou médianes percentiles: APACHE, Physiologie Aiguë et Evaluation de la Santé Chronique; CURB-, confusion, urée, fréquence respiratoire, tension artérielle; IDSA / ATS, Société des maladies infectieuses d’Amérique / American Thoracic Society; SAPS, score de physiologie aiguë simplifiée; SOFA, Évaluation séquentielle des défaillances d’organesa Au cours des premières heuresb À l’admissionView Large

DISCUSSION

L’utilisation de tampons NP a également été critiquée, car ils peuvent ne pas représenter les résultats réels des voies respiratoires inférieures Cela pourrait avoir été le cas pour les patients SCAP dans la présente étude chez qui le virus a été détecté seulement avec NP. Dans la présente étude, la récupération de la PCR virale était plus élevée dans les échantillons des voies respiratoires inférieures que dans les prélèvements de NP. Le rhinovirus a été découvert en% des patients SCAP, ce qui est plus élevé que ce qui a été précédemment rapporté. % des résultats du rhinovirus ont été détectés dans les échantillons des voies respiratoires inférieures L’importance des échantillons des voies respiratoires inférieures pour la détection virale a également été observée pendant la pandémie de grippe HN en La méthode PCR choisie peut également influencer les résultats; un test PCR commercial aurait manqué% des cas de SCAP rhinovirus par rapport à notre test interne Pris ensemble, l’utilisation systématique de méthodes d’échantillonnage respiratoire invasif et notre test de virus interne personnalisé peut expliquer le rendement total plus élevé des virus dans le présent L’analyse virale du liquide BAL a été particulièrement utile pour les patients immunodéprimés Dans cette série, la présence de virus dans les échantillons respiratoires chez les patients SCAP a été démontrée dans près de la moitié des patients immunodéprimés. les cas Ce résultat peut avoir des implications sur le point de transmission des virus respiratoires en USI, en particulier chez les patients SCAP ventilés non invasifs. Des études plus approfondies sont nécessaires pour démontrer l’importance pronostique de la transmission possible des infections virales respiratoires en milieu critique. dans CAP ont été considérés comme provoquant une inflammation plus grave Dans la présente série, le groupe d’infections bactériennes virales mixtes semblait avoir besoin d’une perfusion de noradrénaline plus longue que le groupe de l’infection bactérienne pure. Des études expérimentales ont montré que, dans les cas de maladies bactériennes respiratoires. En revanche, dans la présente étude et dans une récente étude coréenne SCAP, la présence de virus ne semble pas affecter les résultats . Ces résultats peuvent suggérer que la coinfection virale dans le contexte de SCAP n’a pas nécessairement une importance pronostique. Le petit nombre de patients dans toutes ces études empêche des conclusions solides, cependant, compte tenu de la importance des infections virales sur les résultats Dans cette série, les patients atteints de SCAP bactérienne étaient plus gravement malades à l’admission, d’après APACHE II scor La durée des symptômes n’a pas différé entre les groupes étiologiques, suggérant que les virus peuvent jouer un rôle essentiel dans la pathogenèse de SCAPDans la présente étude, à la fois le CRP et Les valeurs PCT semblaient être plus élevées dans le groupe bactérien-viral mixte par rapport aux patients bactériens SCAP purs. Cette question a été soulevée par le fait que cette différence était due à une inflammation plus intense dans le groupe bactérien-viral mixte. infections virales probablement pures Ces patients présentaient cependant des concentrations de PCT beaucoup plus élevées qu’on ne le pensait jusqu’ici pour différencier les infections bactériennes des infections virales En outre, les patients de notre série du groupe d’infection virale probablement pure avaient effectivement reçu des antibiotiques avant l’échantillonnage respiratoire De plus, si les tests de PCR pour les causes bactériennes communes de la PAC et du M pneumoniae Il a été démontré que, pour obtenir un meilleur rendement des diagnostics viraux chez les patients SCAP, des méthodes de PCR multiplex hautement qualifiées avec un prélèvement invasif sont disponibles. L’utilisation plus large de cette approche doit être soigneusement étudiée jusqu’à ce que des agents antiviraux pour le traitement des virus respiratoires communs soient disponibles. Des agents antiviraux sont actuellement disponibles pour le virus de la grippe et les adénovirus. – Si les résultats de la PCR avaient été Les principaux résultats de cette étude étaient les suivants: L’étiologie de SCAP a été diagnostiquée chez% des patients de l’étude, et les virus respiratoires ont été détectés en%. L’étiologie virale n’a pas eu d’impact sur la sévérité de la maladie ou sur les résultats cliniques. conclusion, une étiologie virale est plus fréquente dans SCAP que ce qui a été rapporté jusqu’à présent La récupération des virus dans pat Les patients atteints de SCAP sont influencés par la disponibilité des techniques modernes de PCR multiplex et par la possibilité d’utiliser des méthodes invasives pour obtenir des échantillons des voies respiratoires inférieures. La présence d’une étiologie virale ne semble toutefois pas affecter les résultats des patients SCAP

Remarques

Remerciements Les auteurs remercient chaleureusement Sinikka Sälkiö, RN, pour son aide au dépistage des patients et aux échantillons de l’étude. Soutien financier Ce travail a été soutenu par le financement public de la recherche en santé et par la société médicale finlandaise DuodecimPotential conflits d’intérêts Tous les auteurs: soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits d’intérêts potentiels Conflits que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués