Maladie invasive non-typhi et salmonellose en Afrique

La salmonelle invasive non-Typhi est endémique en Afrique subsaharienne, où elle est une cause majeure d’infection sanguine. Certains facteurs de risque de l’hôte ont été établis, mais on en sait peu sur les réservoirs environnementaux et les modes de transmission prédominants. la transmission des animaux aux humains prédomine dans les pays à revenu élevé, il a été postulé que la transmission entre humains, à l’intérieur et à l’extérieur des établissements de santé, peut être importante en Afrique subsaharienne. La résistance antimicrobienne à l’ampicilline, triméthoprime-sulfaméthoxazole et chloramphénicol est courante parmi les souches de Salmonella non Typhi; Le développement de vaccins ciblant les principaux sérotypes non-Typhi de Salmonella Typhimurium et Enteritidis est justifié La présentation clinique d’une bactériémie non-Typhi à Salmonella n’est pas spécifique et, en l’absence d’hémoculture, peut être confondue avec d’autres maladies fébriles, telles que le paludisme Il reste beaucoup à faire pour comprendre et contrôler la maladie invasive non-typhi de Salmonella en Afrique subsaharienne

Salmonella enterica sous-espèce enterica comprend & gt; sérotypes trouvés chez l’homme et chez d’autres animaux à sang chaud Les sérotypes non-Typhi S enterica sont abrégés en utilisant leur nom de sérotype – par exemple, Salmonella Typhimurium Non-Typhi Salmonella NTS est l’un des pathogènes bactériens les plus courants chez les adultes et les enfants. Afrique subsaharienne Enfants & lt; Les adultes infectés par le VIH portent la plus grande partie du fardeau des maladies invasives, et la mortalité dans ces groupes est élevée. Cela contraste avec les pays développés, où la maladie NTS est habituellement une diarrhée auto-limitée, et la mortalité est plus faible.

Fardeau de la maladie

La maladie invasive du SNS est endémique en Afrique subsaharienne rurale et urbaine Le fardeau de la mortalité due aux maladies bactériennes invasives de l’enfance peut être plus élevé que celui dû au paludisme infantile dans certaines communautés africaines Dans les régions rurales du Kenya, l’incidence minimale per, années-personnes dans le groupe d’âge de & lt; Dans les régions rurales du Mozambique, l’incidence des bactériémies infantiles était de 1 cas par an et par an chez les enfants de moins de 18 ans. Dans cette catégorie, l’incidence du SNRC représentait les cas par personne et par année L’incidence réelle de la bactériémie est probablement multipliée par ce chiffre, car l’incidence de la bactériémie chez les enfants qui meurent avant d’atteindre l’hôpital de district Dans une étude sur l’impact du vaccin antipneumococcique conjugué en Gambie, une incidence de la bactériémie NTS des cas par personne-année chez les enfants âgés de ⩽ mois a été démontrée En Ouganda, une bactériémie NTS a été rapportée être rare chez les adultes avec CDT-lymphocytes compte des numérations de cellules CD & gt; cellules / mm, mais l’incidence était des cas par année-personne chez les adultes avec un nombre de cellules CD de – cellules / mm et était des cas par, années-personnes chez les adultes avec des numérations de cellules CD & lt; cellules / mm Les estimations de la létalité invasive de la maladie chez les patients hospitalisés en Afrique ont été de l’ordre de% -% pour les enfants [, -] et% -% pour les adultes NTS que pour toute autre cause commune de méningite bactérienne Par exemple, au Malawi,% de nouveau-nés atteints de méningite NTS sont décédés, comparé à% de nouveau-nés atteints de méningite streptocoque du groupe B Bien que ces études fournissent un aperçu du fardeau En Afrique, la plupart des études se sont concentrées sur les groupes à haut risque tels que les jeunes enfants et les adultes infectés par le VIH. L’incidence réelle varie selon la prévalence de l’infection par le VIH, les conditions locales et la répartition par âge. L’Afrique saharienne devrait être plus élevée que l’incidence de la fièvre typhoïde, qui a été estimée à un nombre de cas par an et par personne en Afrique De plus, des études en milieu hospitalier suggèrent que la fièvre typhoïde Les données sur la fréquence des complications de la bactériémie NTS en Afrique sont limitées La méningite, l’arthrite septique et l’ostéomyélite ont été décrites [, -], en particulier chez les enfants, pour lesquels le SNRC peut être [Gordon et al.] ont étudié des adultes malawiens atteints de bactériémie NTS pour une maladie suppurative focale et n’ont identifié aucune infection NTS localisée lors de la présentation initiale des enfants atteints de bactériémie NTS au Malawi au cours de l’année. ; Au cours de la même période, des adultes atteints de bactériémie NTS ont été identifiés et un pourcentage estimé de VIH infecté par le VIH. Une étude autopsie sud-africaine des patients décédés et présentant un diagnostic clinique précoce de tuberculose. a révélé que% étaient infectés par le VIH et que% des patients infectés par le VIH hébergeaient un SNS splénique

Facteurs de risque et stratégies de prévention

Les facteurs de risque de l’infection par le NTS en Afrique n’ont pas été bien caractérisés; Par conséquent, les interventions de prévention fondées sur des données probantes sont limitées. Les petites études africaines et les études de prévention fondées sur des données probantes réalisées dans des pays plus développés peuvent fournir des indices jusqu’à ce que davantage de données provenant d’Afrique soient disponibles.

TableauFormeFiche de téléchargement Facteurs de risque pour la bactérie Salmonella non typhi en AfriqueTableFiche largeTélécharger Facteurs de risque pour la bactérie Salmonella non typhi en AfriqueLes études prospectives de l’infection NTS entérique qui étudient les facteurs de risque de bactériémie sont limitées. Une étude nord-américaine a noté une incidence de bactériémie de% chez les nourrissons atteints de diarrhée, mais les facteurs de risque modifiables n’ont pas été identifiés

Facteurs de risque environnementaux

Alimentation et eau Les pics saisonniers de la maladie NTS surviennent avec la saison des pluies chez les adultes et les enfants [,,,], suggérant que les facteurs de risque environnementaux sont importants. Les organismes fécaux se trouvent aux concentrations les plus élevées en Afrique. la saison des pluies , ce qui peut correspondre à un risque accru de NTS d’origine hydrique Protection de l’eau de source; un meilleur accès à de l’eau potable traitée au centre; des stratégies telles que l’utilisation de contenants à gueule étroite et à embout mâle pour le stockage de l’eau ; Le traitement de l’eau à la maison par chloration, désinfection solaire, filtration, floculation ou une combinaison de mesures peut réduire le risque de diarrhée De nombreuses épidémies de maladies d’origine alimentaire dues aux NTS ont été étudiées dans les pays industrialisés. La viande, les œufs, les produits laitiers et les produits laitiers ont tous été impliqués comme vecteurs de transmission. NTS infectent ou colonisent la plupart des espèces de mammifères. Les aliments, tels que les poulets, ont été au centre des efforts pour réduire la transmission du NTS aux humains. L’identification et la gestion des dangers, facilitées par l’échantillonnage microbiologique aux points de contrôle critiques de la ferme à la fourchette, ont été utilisées dans les pays en développement et les pays industrialisés pour améliorer la sécurité alimentaire et contrôle de la maladie NTS Transmission et transmission zoonotiques entre humains Contact avec les animaux, en particulier manipulation de jeunes chicke est un facteur de risque bien établi pour l’acquisition de la maladie NTS dans les pays industrialisés Bien qu’il ne soit pas souvent considéré comme un facteur de risque commun dans les études des pays développés, la transmission apparente entre les humains est relativement plus importante en Afrique Kariuki et al ont démontré le portage de souches identiques de NTS dans les selles des contacts domestiques humains d’enfants atteints de maladie invasive et un manque de telles souches dans l’échantillonnage environnemental et domestique des animaux, bien qu’une source commune de Une étude kényenne du transport NTS à l’admission à l’hôpital a montré que% d’enfants mais aucun d’adultes ne portaient un NTS Dans les pays développés, on sait que les enfants sont susceptibles d’excréter le NTS dans leurs selles pendant plusieurs semaines après s’être remis d’une infection entérique. Infections contractées en milieu hospitalier Les épidémies de NTS en milieu hospitalier peuvent être particulièrement sévères dans les services de pédiatrie des pays en développement, où les enfants peuvent être mal nourris et présenter d’autres risques pour l’hôte. Dans les hôpitaux africains, les aliments sont souvent fournis par la famille du patient Bien que peu d’études aient examiné les facteurs de risque d’infection dans les foyers hospitaliers, les aliments contaminés et la transmission d’une personne à une autre ont été fréquemment observés. Par des souches de STN résistantes à la thérapie empirique locale Parmi les patients adultes et pédiatriques souffrant de diarrhée nosocomiale dans un hôpital du Kenya,% des cas étaient dus aux espèces Salmonella et% aux espèces Shigella Parmi les enfants âgés de quelques mois à années, les antimicrobiens récents l’utilisation et les conditions de vie surpeuplées à la maison étaient associées à la diarrhée d’origine hospitalière due à Salmonel Parmi les adultes, le partage d’une chambre d’hôpital avec une personne ayant une diarrhée et des antécédents d’hospitalisation était associé à une diarrhée à Salmonella ou à Shigella. Les stratégies de prévention pourraient inclure l’éducation des patients et des visiteurs. approvisionnement en eau potable, lavage des mains avant et après le contact avec le personnel soignant, nettoyage soigneux du milieu hospitalier, réduction du surpeuplement, évitement du partage des lits, augmentation du nombre d’agents de santé, désinfection adéquate du matériel réutilisable, surveillance de l’infection NTS et isolement des cas identifiés

Facteurs de risque de l’hôte

Âge Enfants et bébés & lt; Les infections endovasculaires avec NTS ont été décrites chez des adultes âgés de plus de 2 ans. ans dans les pays industrialisés L’âge avancé peut aussi être un facteur de risque dans les populations africaines mais dominé par la maladie NTS associée au VIH chez les jeunes adultes. Exposition aux agents antimicrobiens L’utilisation récente d’agents antimicrobiens est un facteur de risque établi de diarrhée NTS Malaria et anémie On soupçonne depuis longtemps que le paludisme augmente le risque d’infection invasive par le NTS et pourrait contribuer à la saisonnalité de la maladie NTS Bien que le mécanisme sous-tendant l’association entre le paludisme et le NTS soit seulement partiellement comprise, l’hémolyse du paludisme peut altérer la fonction des macrophages et des neutrophiles en raison de l’accumulation de pigment paludéen par les phagocytes, de la saturation des protéines liant le fer et de la disponibilité accrue du fer en NTS, un organisme sidérophile. et bactériémie NTS a , d’autres ont démontré une association entre le paludisme récent ou l’anémie palustre et le NTS, par rapport à d’autres causes de bactériémie [,,] Ainsi, les mesures visant à lutter contre le paludisme peuvent potentiellement réduire l’incidence de la maladie En Afrique tropicale, la malnutrition a été associée à la bactériémie NTS chez les enfants à Kilifi, au Kenya. La malnutrition, la rougeole et les maladies diarrhéiques étaient des raisons fréquentes d’hospitalisation chez les enfants qui ont développé une NTS à l’hôpital au Rwanda. & lt; les années sont plus à risque pour la maladie NTS, les personnes âgées les mois semblent être relativement protégés, peut-être à la fois par les anticorps maternels et par l’allaitement maternel exclusif, qui fournit du colostrum et limite l’exposition à l’eau et à la nourriture contaminées par le VIH. L’infection par le VIH est la plus forte chez les adultes La bactériémie récurrente du SNTS est une condition de l’OMS. Le traitement prophylactique par le triméthoprime-sulfaméthoxazole est recommandé pour prévenir l’apparition d’infections opportunistes chez les patients infectés par le VIH . Le traitement antirétroviral combiné a été associé à des réductions spectaculaires de l’incidence de la diarrhée NTS et de la bactériémie NTS chez les personnes infectées par le VIH dans les pays développés L’infection par le VIH est également un risque facteur de bactériémie chez les enfants, y compris la bactériémie NTS H IV a été associée à une bactériémie chez les enfants à Kilifi, Kenya odds ratio; % intervalle de confiance, – et avec NBS bactériémie odds ratio,; % intervalle de confiance, – Suppression de l’acide gastrique L’utilisation de médicaments qui réduisent l’acidité gastrique est associée à un risque accru d’infection gastro-intestinale Les nourrissons ont une achlorhydrie gastrique relative, comparativement aux adultes, ce qui peut contribuer à leur risque de NTS. homozygotes pour la drépanocytose sont particulièrement à risque de septicémie bactérienne, y compris la bactériémie NTS Des cas consécutifs d’ostéomyélite aiguë compliquant la drépanocytose au Nigéria impliquant des patients ayant un âge moyen de plusieurs années, des mois et des années, ont pu avoir une culture de sang ou de sang. le pus est présent et la moitié des cas sont dus à des espèces de Salmonella Schistosomiase La schistosomiase intestinale peut être un facteur de risque de maladie invasive du SNS chez les enfants dans les zones endémiques Cependant, chez les adultes infectés par le VIH au il n’a pas été démontré que les helminthes étaient associés à la bactériémie NTS

Présentation clinique et diagnostic

Fièvre ou sueurs ont été notées parmi% et splénomégalie chez% des adultes malawiens à la présentation initiale avec bactériémie NTS, caractéristiques qui sont également observées dans le paludisme. Le taux d’hémoglobine médian dans ce groupe, dont le% était infecté par le VIH, était g / dL. g / dL La fièvre et la splénomégalie ont prédit une bactériémie NTS chez les adultes hospitalisés au Malawi En Tanzanie, les patients admis à l’hôpital pour un traitement antipaludique étaient plus susceptibles de mourir lorsque les résultats d’un test étaient négatifs que lorsque les résultats étaient positifs. , ce qui suggère qu’un manque de capacité à diagnostiquer et traiter les infections non-malariques, comme la septicémie bactérienne, peut contribuer aux résultats. Parmi les enfants atteints de bactériémie NTS au Kenya, la splénomégalie était présente en% et la fièvre en% ,% de tous les décès d’enfants hospitalisés étaient associés à une bactériémie, tandis que% de ces décès étaient associés au paludisme. Parmi les enfants atteints de paludisme décédés,% présentaient également une bactériémie NDA bactériémie [Peters] et al ont noté que, bien que le pneumocoque ou la septicémie mycobactérienne chez les patients adultes puissent souvent être diagnostiqués cliniquement avant que les résultats de l’hémoculture soient disponibles, la septicémie NTS était beaucoup plus difficile à diagnostiquer en raison de symptômes et de signes non spécifiques Le syndrome de la pneumonie infantile chevauche à la fois le paludisme et le sepsis NTS [,,] Comme le diagnostic clinique de bactériémie NTS est difficile, des installations d’hémoculture sont nécessaires pour le diagnostiquer et effectuer une surveillance précise. politique de santé publique Malheureusement, une infrastructure de laboratoire clinique adéquate fait souvent défaut dans les pays africains pauvres en ressources . Les résultats ont été étudiés parmi les adultes malawiens atteints de bactériémie NTS, dont le% étaient infectés par le VIH; % sont morts en l’espace d’un mois et% sont morts dans l’année après la présentation de l’indice, et% des survivants initiaux ont eu au moins une récidive de bactériémie NTS. Les tests moléculaires ont révélé que la récurrence était due à la recrudescence plutôt qu’à la réinfection. de la persistance du SNT intracellulaire dans le système réticulo-endothélial

Gestion clinique

Le traitement empirique de la septicémie infantile conformément aux directives de l’OMS , avec la pénicilline et le chloramphénicol ou l’ampicilline et la gentamicine, peut ne pas couvrir adéquatement les maladies résistantes à l’ampicilline, au triméthoprime-sulfaméthoxazole et au chloramphénicol. La gentamicine a une activité limitée contre les pathogènes intracellulaires. Bien que les isolats puissent sembler sensibles in vitro, la gentamicine ne peut être invoquée in vivo. Les lignes directrices de l’OMS recommandent que, lorsqu’il existe une résistance antimicrobienne substantielle connue aux agents antimicrobiens traditionnels de première intention, l’utilisation d’une céphalosporine de troisième génération soit appropriée. la pénétration de fluides de la ceftriaxone en fait un bon choix pour le traitement de la méningite Un récent rapport sur la méningite pédiatrique du NTS au Malawi a démontré un taux de létalité statique de ~% mais une diminution des séquelles permanentes au cours du temps, éventuellement associée à un changement de durée. de la thérapie à partir de semaines The Centers for Disease Con Trol et Prevention recommandent la ciprofloxacine pour le traitement de la bactériémie NTS chez les adultes infectés par le VIH, administrée pendant – des semaines si le nombre de cellules CD est & lt; Une prophylaxie secondaire à long terme Les données pour guider la durée du traitement ou la prophylaxie secondaire chez les nouveau-nés, les patients atteints de méningite et les personnes infectées par le VIH en Afrique manquent de Salmonella sérotype Typhi avec une sensibilité réduite à la ciprofloxacine, souvent associée à des nalidixic la résistance aux acides peut ne pas répondre adéquatement au traitement par la ciprofloxacine On ne sait pas si cela est également vrai pour les SNT Lorsque les patients atteints de bactériémie NTS ne répondent pas à un traitement antimicrobien approprié, une recherche de la maladie focale et de la co-infection par la schistosomiase est justifiée

Microbiologie

S Typhimurium et Salmonella Enteritidis sont les sérotypes les plus communs de NTS causant des maladies humaines en Afrique subsaharienne [,,,,,] L’acquisition d’un plasmide porteur d’un phénotype multirésistant peut être associée à une dissémination réussie. Typhimurium au Malawi Salmonella Isangi était un sérotype rare en Afrique du Sud jusqu’à ce qu’il s’étende à un pourcentage d’isolats NTS dans un programme national de surveillance et produise une β-lactamase à spectre étendu Antimicrobial resistance of NTS to le triméthoprime-sulfaméthoxazole, l’ampicilline et le chloramphénicol sont devenus courants en Afrique subsaharienne, ce qui limite la valeur de ces agents pour la gestion des SNT envahissantes [,,,]

Perspectives de vaccins NTS

La virulence du NTS dépend de sa capacité à se développer dans les macrophages du système réticulo-endothélial La réplication extracellulaire et la dissémination bactériémique surviennent également. La résistance à la destruction du complément, au moyen du lipopolysaccharide à longue chaîne, est un important trait de virulence. sont nécessaires pour tuer des espèces de Salmonella in vitro Bien que des échantillons de sérum provenant d’adultes africains en bonne santé aient été capables de tuer le NTS, des échantillons de sérum provenant d’enfants âgés de & lt; Il est probable que cela explique la prédisposition des jeunes enfants à la maladie invasive du NTS et pourrait nous aider à comprendre un mécanisme par lequel le dérèglement immunitaire de l’infection par le VIH contribue au risque de maladie NTS. De tels indices immunologiques suggèrent que le développement de vaccins dirigés vers les sérotypes invasifs communs pourrait être une approche utile pour prévenir la maladie invasive du NTS.

Conclusions et orientations futures

Comme les maladies invasives causées par Streptococcus pneumoniae et Haemophilus influenzae sont contrôlées par des stratégies vaccinales, la salmonellose non invasive peut consolider sa position en tant que principale cause d’infection de la circulation sanguine en Afrique subsaharienne, en dépit du fardeau considérable que représentent les maladies et les décès. Une compréhension plus claire de l’incidence, des complications et des taux de létalité au niveau de la population serait précieuse pour décider de la manière de prioriser les ressources de soins de santé en Afrique subsaharienne. Une intensification de l’accès à la culture hémophilique ou à des méthodes diagnostiques alternatives améliorées est nécessaire pour soutenir de telles études, améliorer les soins aux patients et informer la recherche sur les politiques pour déterminer les principales sources et modes de transmission environnementaux et caractériser les facteurs de risque de colonisation muqueuse. ou une infection et pour une maladie invasive est nécessaire d’urgence. Pour mieux comprendre le syndrome des NTS invasifs en Afrique subsaharienne, y compris la proportion de personnes ayant une diarrhée ou un transport NTS qui développent également une maladie invasive, la pathogenèse, la prévalence du portage et l’excrétion chronique et le risque de bactériémie NTS Les algorithmes de prise en charge de la maladie fébrile doivent être continuellement réévalués pour tenir compte de l’importance relative du paludisme par rapport aux infections bactériennes invasives telles que le SNRC. Études cliniques d’efficacité et surveillance de la résistance aux antimicrobiens et du sérotype la distribution est nécessaire pour éclairer les stratégies de prise en charge clinique, pour détecter les changements dans les caractéristiques de la maladie et pour aider au développement du vaccin

Remerciements

Soutien financier Prix des Instituts nationaux de la santé des États-Unis: Programme international de formation et de recherche sur le SIDA, Centre international Fogarty D – HOR et JAC, Études internationales sur les co-infections associées au SIDA AI à HOR et JAC, Centre de recherche sur le SIDA de l’Université Duke AI à HOR et JAC, et à l’unité d’essais cliniques de Duke et aux sites de recherche clinique AI- à JAC; le Centre Hubert-Yeargan pour la santé mondiale et le Duke Clinical Research Institute Prix Synderman, Duke University Medical Center aux conflits d’intérêts SCMPotential Tous les auteurs: no conflicts